С начала июня по октябрь 1942 года — начальник оперативного отдела 9-й резервной армии (31.08.1942 переименована в 24-ю армию четвёртого формирования)[2].
Весной 1945 года в составе 4-й гвардейской армии дивизия принимала участие в освобождении Венгрии, а затем и Австрии.
13 апреля 1945 года дивизия под командованием генерал-майора Афонина участвовала в освобождении Вены.
Шесть раз П.И. Афонин был упомянут благодарственных в Приказах Верховного Главнокомандующего. Великую Отечественную войну завершил в австрийском городе Санкт-Пёльтен.
Приказы (благодарности) Верховного Главнокомандующего в которых отмечен Афонин П. И.[5]
За овладение столицей Молдавской ССР городом Кишинев – важным узлом коммуникаций и мощным опорным пунктом обороны противника. 24 августа 1944 года № 173
За овладение городами Секешфехервар и Бичке (Венгрия) – крупными узлами коммуникаций и важными опорным пунктами обороны противника. 24 декабря 1944 года № 218
За овладение столицей Венгрии городом Будапешт – стратегически важным узлом обороны немцев на путях к Вене. 13 февраля 1945 года. № 277
За овладение городами Секешфехервар, Мор, Зирез, Веспрем, Эньинг, а также более 350 других населенных пунктов. 24 марта 1945 года. № 306
За овладение городом Шопрон – крупным железнодорожным узлом и важным опорным пунктом обороны немцев на подступах к Вене. 1 апреля 1945 года. № 324
За овладение столицей Австрии городом Вена – стратегически важным узлом обороны немцев, прикрывающим пути к южным районам Германии. 13 апреля 1945 года. № 334